叠氮溴化丙锭，化学名为Propidium Monoazide，简称PMA，是一种光反应的DNA结合染料。以下是对其的详细解析：

结构与特性：PMA的结构中包含了一个叠氮基团（Monoazide），这个基团在光照条件下（通常是紫外光或可见光）能够变得高度反应活性，从而与DNA的碱基（主要是鸟嘌呤）发生共价结合。然而，在没有光照的情况下，PMA与DNA的结合能力相对较弱，且不易发生反应。PMA是一种高亲和性的DNA结合染料，该染料本身具有微弱的荧光，但与核酸结合后可以发出更为明亮的荧光，尤其与双链DNA具有高亲和性。

应用：

区分活细胞与死细胞：在微生物群落分析中，PMA常被用来处理样品，以去除死细胞或受损细胞的DNA信号，从而只分析活细胞的DNA。这有助于更准确地评估微生物群落的真实结构和活性。

流式细胞术：在流式细胞术中，PMA可以与荧光染料结合使用，以区分活细胞与死细胞。活细胞由于细胞膜完整，不会被PMA标记，而死细胞则会被PMA标记并随后与荧光染料结合，从而在流式细胞仪上产生可区分的信号。

环境微生物学研究：在环境微生物学研究中，PMA也被用来评估不同环境条件下微生物群落的活性。通过比较处理前后微生物群落的变化，可以了解环境因素对微生物活性的影响。

使用注意事项：

PMA不具有细胞膜渗透性，因此可选择性地修饰膜受损的死细胞的DNA。

PMA修饰的DNA经蓝光（~464nm）光解后，PMA上的光反应性叠氮基转化为高反应性氮烯自由基，与DNA结合位点附近的任何烃部分反应形成稳定的共价氮碳键，从而导致永久性DNA修饰。该修饰过程会使DNA不溶，并使其在随后的基因组DNA提取过程中与细胞碎片一起丢失，进而阻碍死细胞中目标DNA的PCR扩增。

残留在溶液中未结合的PMA，在强光照射下与水分子反应分解成无交联活性的羟胺化合物，使羟胺不再能够共价结合DNA，从而不影响PCR扩增。

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