Sulfo Cy5-Mal在细胞示踪和免疫染色方面也具有重要应用。通过与细胞内的蛋白质或多肽等生物分子中的巯基发生特异性结合，Sulfo Cy5-Mal可以在荧光显微镜下实现对活细胞的实时成像。这种成像技术有助于研究者观察细胞内的蛋白质分布、相互作用以及细胞动态变化。

在免疫染色实验中，Sulfo Cy5-Mal可以用于标记抗体来检测目标蛋白质在细胞或组织中的位置和表达水平。这种技术结合荧光显微镜的使用，可以实现在细胞和组织水平上可视化蛋白质的定位和分布。高度特异性的巯基-马来酰亚胺反应确保了染料与目标分子的精确结合，从而提高了检测的准确性和灵敏度。

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