CY5-Rapamycin是通过将CY5荧光染料与雷帕霉素分子进行共价键合而制得的荧光探针。具体的标记方法可能包括以下几种：

直接共价键合法：通过化学反应将CY5或其衍生物与雷帕霉素分子上的特定官能团（如氨基、巯基等）进行共价键合，形成稳定的荧光标记物。

酶催化法：利用特定的酶（如生物素连接酶）催化CY5与雷帕霉素之间的连接，实现荧光标记。这种方法可能需要先将雷帕霉素与生物素结合，然后再通过与亲和素结合的CY5进行标记。

点击化学反应法：如铜催化的叠氮-炔烃环合反应，可以将CY5与雷帕霉素进行标记。这种方法通常需要在特定的化学条件下进行。

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