近年来，随着生物正交反应和点击化学的兴起，NAEK在蛋白质标记方面的应用得到了进一步拓展。例如，北京大学药学院夏青课题组利用基因密码子扩展技术，将NAEK注入小鼠体内，实现了对内源性蛋白质dystrophin的标记和功能恢复。这项研究不仅展示了NAEK在蛋白质标记方面的应用，也为治疗Duchenne肌营养不良症（DMD）提供了新的思路。

此外，北京大学刘涛团队开发的基于RNA编辑的密码子扩展技术（RENAPT），可以在不影响基因序列的前提下，实现在目标蛋白mRNA水平引入终止密码子，并通过非经典氨基酸系统，将荧光ncAA或具有生物正交反应手柄的ncAA进行后续染料标记在活细胞中，仅使用最小的氨基酸侧链标签，实现特异性地标记多种内源蛋白质。这一技术进一步推动了NAEK在蛋白质标记领域的应用。

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