Cy5.5-NHS ester（CAS：2054318-82-8）是一种常用的荧光标记分子，其末端含有NHS（N-羟基琥珀酰亚胺）酯基团，可以与生物大分子的氨基反应，形成稳定的共价键。Cy5.5-NHS ester在生物医学研究中广泛用于分子成像、免疫学研究和细胞追踪等领域。

首先，Cy5.5-NHS ester作为一种荧光探针，常用于细胞标记和分子成像。Cy5.5是一种近红外荧光染料，其发射光波长在700 nm附近，能够穿透生物组织深部，因此非常适合用于体内成像。通过将Cy5.5-NHS ester与抗体、肽或其他生物分子偶联，可以实现靶向成像，帮助研究人员观察特定分子或细胞在体内的分布和变化，尤其在肿瘤成像、血管成像和神经系统研究中具有重要应用。

其次，Cy5.5-NHS ester在免疫学研究中也有着重要应用。通过将Cy5.5标记的抗体用于流式细胞术或免疫组织化学分析，可以实现高灵敏度的检测和定量分析，帮助研究人员研究免疫反应、细胞信号传导和疾病机制。

此外，Cy5.5-NHS ester还可以用于药物递送系统中的追踪。在药物递送研究中，将Cy5.5-NHS ester与药物载体结合，可以实现对药物在体内的分布、释放和靶向效果进行实时监测。

综上所述，Cy5.5-NHS ester作为一种强效的荧光标记分子，广泛应用于分子成像、免疫学研究、药物递送系统等领域，是生物医学研究中非常重要的工具。