SYBR Green I 荧光染料的应用场景和颜色是什么?
SYBR Green I 是一种常用于分子生物学中的绿色荧光核酸染料,能够与双链DNA(dsDNA)特异性结合并增强其荧光强度,常用于 实时荧光定量PCR(qPCR)、琼脂糖凝胶电泳染色、DNA定量检测等。
基本信息
名称:SYBR Green I
发射颜色:绿色荧光
激发波长(Excitation):约 497 nm
发射波长(Emission):约 520 nm
荧光增强:与dsDNA结合后荧光增强超过1000倍
结构:为非共价结合小分子染料,具有疏水性吡啶结构,可插入双螺旋结构中
应用场景
实时荧光定量PCR(qPCR)
SYBR Green I在PCR扩增过程中不断与新合成的双链DNA结合,从而同步监测荧光强度,反映扩增产物的量。
优势:操作简单、价格低廉、可用于广泛的引物对
劣势:特异性不如TaqMan探针,因为SYBR Green无法区分特异扩增与非特异扩增(如引物二聚体)
琼脂糖凝胶染色
可作为替代溴化乙锭(EB)的低毒DNA染料,荧光强度高,安全性更好
通常在预染或泳后染色步骤使用
DNA定量检测
通过与标准曲线比对,可用于快速测定DNA浓度
注意事项
特异性问题:SYBR Green I 只要与双链DNA结合就能发光,因此可能会对非特异产物(如引物二聚体)产生信号干扰。
高浓度抑制反应:过量的SYBR Green可能会抑制PCR反应,建议使用厂家推荐浓度(通常为1×工作浓度)。
不适用于RNA直接检测,除非先进行反转录。
避光保存:对光敏感,应在避光、低温(通常为-20°C)条件下保存。
✅ 优点
使用方便,兼容性好
成本低于TaqMan探针类染料
与大多数qPCR平台兼容
可广泛用于常规PCR和电泳分析
缺点
对非特异性扩增敏感
无法用于多重PCR检测
难以区分不同片段大小的产物
荧光定量PCR或核酸电泳实验,SYBR Green I 是一个常用且高效的工具。需要提高特异性时,建议结合熔解曲线分析或考虑使用特异性探针(如TaqMan)。