常用名 CY3-亚磷酰胺

英文名 3H-Indolium, 2-[3-[1-[3-[[[bis(1-methylethyl)amino](2-cyanoethoxy)phosphino]oxy]propyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propen-1-yl]-1-[3-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethoxy]propyl]-3,3-dimethyl-, chloride (1:1)

CAS号 182873-76-3

分子量 953.65

密度 N/A

沸点 N/A

分子式 C58H70ClN4O4P

熔点 N/A

基本信息

Cyanine3 phosphoramidite是一种有机荧光染料，化学式为C₄₆H₅₆N₄O₆PS。它是一种重要的生物标记试剂，分子量约为750左右。通常以固体粉末的形式存在，具有良好的化学稳定性和光稳定性。

化学结构与性质

Cyanine3 phosphoramidite的核心是花青染料结构，这种结构使其在可见光区域（通常在550 - 600 nm波长）具有强烈的吸收和发射特性。其荧光颜色通常为橙红色，荧光量子产率较高，这使得它在荧光成像和检测中具有较高的灵敏度。

与Cyanine7类似，Cyanine3 phosphoramidite也含有磷酸三酰胺部分，这使得它能够方便地与核酸进行偶联。通过与核酸的磷酸基团反应，它可以将花青染料共价连接到DNA或RNA分子上。这种标记方法具有高效、特异性强的特点，不会显著影响核酸的生物活性。而且，Cyanine3的荧光特性使其在荧光显微镜下能够清晰地显示核酸的位置和分布。

应用领域

在生物医学领域，Cyanine3 phosphoramidite主要用于核酸的荧光标记。例如，在原位杂交实验中，它可以用于标记特异性的核酸探针。通过与目标核酸序列杂交，标记了Cyanine3的探针可以在荧光显微镜下清晰地显示出目标核酸的位置，从而实现对特定基因或转录本的定位分析。

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