Sulfo-Cy5-E SE是一种磺化花青类荧光染料的琥珀酰亚胺酯形式，具有优良的光学性质和生物相容性。磺化花青5（Sulfo-Cy5）是一种在远红光区域具有强烈吸收和发射的荧光染料，其激发和发射波长分别约为645 nm和665 nm，使其适用于多种生物医学成像应用。

从化学结构上看，磺化花青5部分赋予了该化合物良好的光学性质，而琥珀酰亚胺酯（NHS酯）部分则是一个常用的生物偶联基团。NHS酯能够与生物分子上的伯胺基团（-NH₂）发生共价结合，生成稳定的酰胺键。这种特性使得Sulfo-Cy5-E SE可以与蛋白质、肽、抗体等生物分子结合，用于荧光标记和成像。

在生物医学应用中，Sulfo-Cy5-E SE广泛用于细胞标记、蛋白质成像和生物传感器开发。例如，在流式细胞术和荧光显微镜成像中，标记有Sulfo-Cy5-E SE的抗体可以用于特异性识别和定位细胞内的目标蛋白。此外，该染料还可以用于开发荧光探针，用于监测细胞内的生物化学反应和环境变化。

Sulfo-Cy5-E SE的磺化基团（-SO₃⁻）赋予了该染料良好的水溶性和生物相容性，使其在生物体系中具有更高的稳定性和更低的背景荧光。这种特性使其特别适用于活细胞成像和体内成像应用。

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