Sulfo-Cy5.5 bis-SE是一种磺化花菁类荧光染料的双琥珀酰亚胺酯形式。花菁类染料以其优良的光学性质和生物相容性而被广泛应用于生物医学成像和荧光标记领域。Sulfo-Cy5.5 bis-SE的激发和发射波长分别约为675 nm和695 nm，使其在远红光区域具有强烈的荧光信号，特别适用于深组织成像和多色成像应用。

从化学结构上看，**磺化基团（-SO₃⁻）**赋予了该染料良好的水溶性和生物相容性，使其在生物体系中具有更高的稳定性和更低的背景荧光。**双琥珀酰亚胺酯（bis-NHS酯）**部分则提供了两个生物偶联位点，能够与生物分子上的伯胺基团（-NH₂）发生共价结合，生成稳定的酰胺键。这种双偶联能力使得Sulfo-Cy5.5 bis-SE可以与蛋白质、肽、抗体等生物分子结合，用于荧光标记和成像。

在生物医学应用中，Sulfo-Cy5.5 bis-SE广泛用于细胞标记、蛋白质成像和生物传感器开发。例如，在流式细胞术和荧光显微镜成像中，标记有Sulfo-Cy5.5 bis-SE的抗体可以用于特异性识别和定位细胞内的目标蛋白。此外，该染料还可以用于开发荧光探针，用于监测细胞内的生物化学反应和环境变化。

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