Amino-11-CTP 是一种经过氨基化修饰的胞苷三磷酸(CTP)核苷酸,结构上在胞苷分子中引入了一个含有氨基功能团的十一碳长链侧链,通常修饰在胞嘧啶碱基的特定位置。它是RNA合成和核酸标记领域的重要功能化核苷酸,广泛应用于体外转录、分子探针设计和核酸生物化学研究中。
结构特点
基础分子为 胞苷三磷酸(CTP),是RNA合成中必需的核苷酸之一,由胞嘧啶碱基、核糖和三磷酸组成。
氨基-11 修饰表示在分子的某个位点(通常是碱基环或核糖上)连接了一个11个碳原子的含氨基长链,使该核苷酸带有一个可供化学反应的氨基官能团。
氨基修饰为该核苷酸分子引入了活泼的反应位点,能够与多种活性化合物(如荧光染料、生物素、交联剂)发生共价结合。
主要应用
RNA标记和功能化
在体外转录反应中,Amino-11-CTP 可作为底物掺入 RNA 分子,合成出带有氨基修饰的功能性 RNA,用于后续荧光标记、亲和纯化或结构研究。
分子探针和传感器设计
含氨基的 RNA 分子可通过化学偶联与荧光团、生物素或其他检测标签结合,制备高灵敏度的RNA探针,用于原位杂交、基因表达分析和分子诊断。
核酸修饰研究
作为带有特定官能团的修饰核苷酸,Amino-11-CTP 允许科学家研究 RNA 与蛋白质、核酸之间的相互作用及其动态变化。
优势特点
兼容性好:大多数 RNA 聚合酶能够接受 Amino-11-CTP 作为底物,保证修饰RNA的有效合成。
化学反应活性强:氨基官能团能够与NHS酯、异硫氰酸酯等多种化学试剂反应,实现多样化的标记和修饰。
增强探针灵敏度:通过荧光或亲和标签的偶联,显著提高RNA检测的灵敏度和特异性。
结构稳定:修饰通常不会显著影响RNA的二级结构和功能,保持其生物活性。
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