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cas:55520-67-7,VdU (5-Vinyl-2'-deoxyuridine)的分子结构与化学特征
发布时间:2025-07-07     作者:zyl   分享到:

5-Vinyl-2′-deoxyuridine (VdU),中文名称为 5-乙烯基-2′-脱氧尿苷,是一种经常应用于核酸化学、分子生物学和化学生物学研究的重要核苷衍生物。它属于修饰型脱氧核苷,其分子结构在胸苷(dT)或脱氧尿苷(dU)基础上,于嘧啶环的 5 位引入了乙烯基基团。

英文名 5-vinyl-2'-deoxyuridine

CAS号 55520-67-7

分子量 254.23900

密度 1.516g/cm3

沸点 N/A

分子式 C11H14N2O5

熔点 N/A

5-vinyl-2'-deoxyuridine

分子结构与化学特征

VdU 的核心骨架仍然是 2′-脱氧核苷,包含嘧啶碱基(尿嘧啶)和 2′-脱氧核糖。其显著特征是碱基的 C5 位上连接了一个乙烯基基团(-CH=CH₂)。这一不饱和基团不仅改变了分子的电子性质,也为后续多种化学修饰或偶联反应提供了反应位点。

乙烯基基团可以参与多种“点击化学”反应(例如羟基自由基加成、自由基聚合反应等),这使得 VdU 成为开发功能化核酸探针或生物材料的原料。

应用领域

1. 寡核苷酸合成与探针开发

VdU 是核酸化学领域中备受关注的修饰单体。在固相合成寡核苷酸过程中,VdU 可被引入到特定位点,从而在寡核苷酸链上生成具有乙烯基功能基团的位点。这些位点可用于:

后续共价偶联荧光染料

连接生物探针或配体

与药物或功能性分子耦合

这样的设计可制备出多功能核酸探针,用于分子成像、靶标识别以及基因检测。

2. 生物正交化学(Bioorthogonal Chemistry)

乙烯基基团是一种出色的化学“手柄”,能够与多种化学试剂进行反应,同时对生物体系具有较低的干扰。在生物正交化学领域,VdU 常用于:

与硫醇、叠氮化合物或其他活性基团反应,进行分子标记

在细胞或体内体系中实现精准的核酸标记

构建多功能纳米药物载体

3. DNA 结构与功能研究

VdU 在研究 DNA 结构和相互作用方面也具有重要价值。其 5-位修饰可:

改变 DNA 双螺旋的稳定性

改变碱基配对特性

用作研究 DNA-蛋白质相互作用的化学探针

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