6-FAM SE,92557-81-8,荧光素NHS活性酯类染料的结构合成
6-FAM SE(6-Carboxyfluorescein N-succinimidyl ester)是荧光素(fluorescein)衍生的NHS活性酯类染料,其结构由荧光素分子主架与一个活化羧酸(羧基活性酯)相连,赋予其与氨基分子共价结合的能力。该染料用于核酸测序、寡核苷酸标记、蛋白质修饰及实时荧光PCR探针制备等领域。
其结构合成路线通常以6-羧基荧光素(6-FAM)为起点。首先在无水有机溶剂如DMF或DCM中,将6-FAM的羧基与N,N’-二环己基碳二亚胺(DCC)或EDC活化,再引入N-羟基琥珀酰亚胺(NHS),生成具有反应活性的6-FAM-NHS酯,即6-FAM SE。该反应通常在惰性气氛(氮气或氩气)中进行,以避免水分导致的水解,并可加入催化剂如DMAP促进反应进行。
终产物为稳定的粉末状橙黄色染料,其SE(NHS酯)基团在中性或碱性条件下(pH 7.5–8.5)可高效与伯胺反应形成酰胺键。这使其特别适合于寡核苷酸5'端标记、氨基修饰引物的荧光接枝及核苷酸衍生物合成。由于FAM荧光信号强烈、量子产率高且发射波长(约520 nm)与常用激光器兼容,因此是Illumina、ABI等测序平台中的标准标记染料。
结构上,6-FAM SE具有刚性平面三环共轭系统,使其荧光性能在共价偶联后仍保持稳定。在合成后的纯化过程中,常采用反相HPLC进行色谱分离,并通过MS与NMR确认其分子结构。其优异的化学稳定性与易于偶联特性,使其成为现代分子生物学中不可或缺的荧光构建模块之一。
英文名称: 6-FAM, SE
中文名称: 6-羧基荧光素琥珀酰亚胺醚
MF: C25H15NO9
MW: 473.39
CAS: 92557-81-8
纯度:95%+
性状:基于不同的分子量,呈白色 / 类白色固体,或液体。
溶剂:溶于二氯甲烷、DMSO、水等常规有机溶剂。
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
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