Cy3-dCTP,花菁类荧光染料CY3共价连接至脱氧胞苷三磷酸的反应步骤
Cy3-dCTP 是将花菁类荧光染料 CY3 共价连接至脱氧胞苷三磷酸(dCTP)分子上的荧光核苷酸衍生物,应用于分子生物学实验,如荧光原位杂交(FISH)、荧光PCR、DNA合成标记、测序等。该标记形式通过在碱基或糖环结构上引入荧光团,实现对核酸合成或模板识别过程的可视化分析。
CY3-dCTP 的合成通常采用核苷酸修饰策略,在保持 dCTP 三磷酸骨架完整性的基础上,引入一个连接基团(如氨基烷基链或氨基酯链)作为染料偶联位点。常用的策略是在 dCTP 的 5-位碱基上引入氨基链(如 aminoallyl-dCTP),再通过与 CY3-NHS 酯进行后期修饰形成酰胺键。
具体反应步骤如下:
合成氨基修饰核苷酸:以脱氧胞苷为起始物,通过在其C5位引入一个氨基烷基侧链,得到 aminoallyl-dCTP。该中间体既保持核苷酸原有的碱基配对能力,又引入一个活泼伯胺,用于后续标记。
CY3-NHS 酯制备与活化:CY3通过与N-羟基琥珀酰亚胺反应形成NHS活酯,使染料具备与胺反应的能力。该酯在干燥有机溶剂(如DMSO)中配制,以保持其活性。
偶联反应:将 aminoallyl-dCTP 溶解于碳酸盐缓冲液(pH 8.5),加入适量 CY3-NHS 酯(通常以1.2–1.5倍摩尔量),在避光条件下温和反应 2–4 小时,生成稳定的 CY3-dCTP。整个过程需严格避免金属离子污染和强氧化环境,以防止核苷酸降解。
纯化过程:反应后使用离子交换色谱或反相HPLC分离纯化,去除未反应染料、缓冲盐及副产物。纯品可进一步冻干保存,确保其三磷酸结构稳定。
验证与储存:通过质谱、核磁共振(NMR)及紫外-可见光谱(UV-Vis)进行结构鉴定,确认荧光团成功引入。CY3-dCTP 需冷冻避光储存(-20°C以下),以维持荧光强度及核苷酸稳定性。
该标记核苷酸可被DNA聚合酶识别并掺入新合成的链中,保留其荧光性质,适用于高灵敏度的分子追踪实验,具有的实验室应用价值。
产品名称:Cy3-dCTP,花菁类荧光染料CY3共价连接至脱氧胞苷三磷酸
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物
关于我们
齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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