CY3-RNA,CY3标记核糖核酸的反应原理
Cy3标记RNA是一种将荧光染料Cy3共价连接至RNA分子的技术,用于RNA定位、定量和动态研究。Cy3-RNA的标记依赖于化学反应实现染料与RNA的稳定结合。
反应原理详解:
标记位点的设计
RNA结构缺乏直接与染料反应的官能团,通常通过合成修饰在RNA的5’端、3’端或特定位点引入胺基修饰,以提供标记位点。常见的修饰包括5’-胺修饰、巯基修饰或含特定修饰核苷。
染料活性基团
Cy3通常以NHS酯(N-羟基琥珀酰亚胺酯)形式提供,活性高,能与氨基官能团形成稳定的酰胺键。
酰胺化反应机理
在碱性缓冲液(pH 8.0-9.0)条件下,RNA上的胺基孤对电子对Cy3-NHS酯的羰基碳发起亲核攻击,释放NHS,生成共价酰胺键,实现染料与RNA的连接。
反应条件
反应通常在室温或4℃进行,时间为1-4小时,既保证充分反应又保护RNA结构。缓冲液常用碳酸盐缓冲液或磷酸盐缓冲液,兼顾溶解性和稳定性。
反应选择性
酰胺化反应具有高度选择性,仅针对胺基,避免非特异性结合,保持RNA其他核苷不受影响。染料与RNA的连接稳定性强,荧光信号持久。
纯化与表征
标记反应完成后,通过凝胶电泳、高效液相色谱(HPLC)或透析去除游离染料及杂质。
产品名称:CY3-RNA
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物
关于我们
齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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