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485397-12-4,BODIPY TMR NHS ester的化学结构与反应性
发布时间:2025-07-30     作者:zyl   分享到:

BODIPY TMR NHS Ester是一种常用于生物偶联和荧光标记的橙红色荧光染料,具有高亮度、高光稳定性和良好的生物相容性。其核心结构源于BODIPY(boron-dipyrromethene,硼-二吡咯亚甲基)荧光团,同时通过引入NHS酯活性基团(N-hydroxysuccinimide ester)赋予其与生物分子高效共价偶联的能力,尤其适用于蛋白质、肽、多肽、小分子、寡核苷酸和纳米材料的标记。

英文名 BDP TMR NHS ester

CAS号 485397-12-4

分子量 495.283

分子式 C25H24BF2N3O5

熔点 N/A

BDP TMR NHS ester

化学结构与反应性

BODIPY TMR NHS Ester 的结构可分为两个功能部分:

BODIPY TMR 荧光团:
BODIPY TMR 是一种结构类似于四甲基罗丹明(TMR)的BODIPY衍生物,吸收和发射波长落在绿光激发-橙红发射区,具有出色的荧光效率。其刚性芳香结构提供强荧光信号、良好的光稳定性以及狭窄的发射光谱峰。

NHS酯反应位点:
NHS酯是一种常用的活性酯,能与含有伯胺(–NH₂)官能团的分子在温和条件下迅速形成稳定的酰胺键。因此,BODIPY TMR NHS Ester 可高效地共价标记蛋白质的赖氨酸残基、氨基修饰的核酸、纳米颗粒表面等。

偶联反应条件

反应对象:含伯胺的分子,如蛋白质(赖氨酸)、氨基寡核苷酸、氨基修饰纳米颗粒等

反应pH:推荐在 pH 7.2–8.5 条件下反应,以保证NHS酯的稳定性和反应性

溶剂系统:染料通常溶于无水DMSO或DMF中,推荐加入反应缓冲液(如PBS、HEPES等)后再与待标记分子混合

反应时间:室温下反应30–60分钟即可完成标记

去除游离染料:标记后可通过透析、凝胶过滤或HPLC等方式去除未结合染料

应用领域

1. 蛋白质和抗体标记

BODIPY TMR NHS ester 可高效地标记抗体、酶和其他蛋白质,用于免疫组化、免疫荧光(IF)、原位杂交(FISH)、Western blot 和免疫沉淀等应用。

2. 寡核苷酸和核酸探针

氨基修饰的寡核苷酸可与BODIPY TMR NHS ester偶联,生成稳定的荧光核酸探针,用于RNA检测、DNA成像、荧光原位杂交、实时PCR探针等。

3. 脂质体与纳米颗粒标记

该染料可以用于脂质体、聚合物纳米粒、量子点表面或微球的氨基修饰标记,用于追踪、成像或递送系统研究。

4. 流式细胞术(FACS)

其橙红色发射光谱使其特别适用于与绿色激发通道配合,作为多色染色中的一员,与FITC、Cy5等染料搭配无光谱重叠干扰。

5. 荧光显微成像

凭借其优异的光稳定性和高亮度,BODIPY TMR 是理想的显微镜荧光染料,可用于细胞器追踪、膜蛋白标记、细胞膜动态研究等。

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