英文名称：CY3-5TAMRA-AMRLERQDSIFYPK-NH2

中文名称：CY3-5-羧基四甲基罗丹明-多肽

CY3-5TAMRA-AMRLERQDSIFYPK-NH2由两种荧光染料（CY3与5TAMRA）与特定氨基酸序列（AMRLERQDSIFYPK）通过化学修饰共价连接，末端以氨基（-NH2）封端。CY3属于花菁类染料，其激发波长约550 nm，发射波长约570 nm，呈现橙红色荧光，具有较高的光稳定性和量子产率；5TAMRA为罗丹明类衍生物，激发/发射波长分别为545 nm和575 nm，同样具备优异的光学性能。两种染料的组合使得该分子在多色荧光实验中具有独特优势，例如可通过不同荧光通道同时追踪多个靶点，减少信号交叉干扰。

氨基酸序列的设计融合了多种功能残基：精氨酸（R）和赖氨酸（K）带强正电荷，可能参与静电相互作用或细胞膜穿透；疏水性残基（如亮氨酸L、苯丙氨酸F）可增强分子与脂质膜或疏水环境的结合能力；谷氨酸（E）和天冬氨酸（D）的负电荷则可能调节分子整体电荷分布，影响其溶解性和稳定性。此外，序列中的丝氨酸（S）和酪氨酸（Y）含有羟基，可作为潜在磷酸化位点或氢键供体，参与分子间相互作用。

该分子的氨基末端具有高反应活性，可进一步与生物素、荧光素或其他功能基团偶联，扩展其应用场景。例如，在蛋白质组学研究中，可通过氨基与固相载体连接，用于亲和纯化或蛋白质芯片制备；在细胞成像中，可结合荧光显微镜或流式细胞术，实现多靶点同步检测。其双染料设计还支持荧光共振能量转移（FRET）实验，通过监测能量传递效率分析分子构象变化或相互作用距离。

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