Cy5-5-COOH 是一种常用的荧光染料，属于氰菁染料（Cyanine Dye）家族。其化学结构中包含一个羧基（–COOH），赋予分子在水相及有机相中的良好溶解性，使其能够在多种实验条件下保持稳定性和可操作性。Cy5-5-COOH 常被称为水溶性或脂溶性 Cy5 羧基衍生物，具体取决于染料分子中疏水与亲水基团的比例，其在极性或非极性环境中的表现略有不同。

化学结构与性质
Cy5-5-COOH 的核心结构是由两个吲哚类环通过共轭双键链连接形成的长共轭体系。这种共轭体系是其具有优异光学特性的关键原因。分子末端的羧基不仅提供了亲水性，还为后续的化学修饰提供了活性位点，使其可以通过酯化或酰胺化等反应与各种功能分子或高分子材料连接。染料分子中部分疏水基团的存在，又使得它在有机溶剂中具有一定溶解度，从而适应不同体系的实验需求。

光学特性
Cy5-5-COOH 在可见光至近红外光区表现出强烈的吸收和发射特性。其典型吸收波长约在 650–660 nm 范围内，而荧光发射峰位于 670–680 nm 左右。该染料具有高荧光量子产率和较长的激发态寿命，使其在需要高灵敏度荧光检测的实验中表现出稳定可靠的性能。与其他荧光染料相比，Cy5-5-COOH 对光照和环境条件具有较强的耐受性，不易发生光漂白或自发降解。

水溶性与脂溶性特征
Cy5-5-COOH 的羧基赋予分子一定的水溶性，可在缓冲液或生物相关体系中形成稳定溶液，便于实验操作。同时，其分子主体的疏水共轭系统使其在有机溶剂中也能保持良好溶解度。这种水/脂双亲特性，使 Cy5-5-COOH 能够适应多种环境，从非极性溶剂到极性水溶体系均可稳定存在，是实验中广泛应用的理想染料。

化学修饰与应用
Cy5-5-COOH 的羧基提供了化学修饰的便利，可以通过活化（如转化为 NHS 酯）与含氨基或羟基的分子偶联，制备出各种功能化的染料衍生物。例如，可以将其连接到高分子材料、纳米颗粒、荧光标记试剂或表面活性分子中，用于光学探测、荧光成像或光学追踪实验中。其水溶性特征也使其适用于需要高亲水性的体系，如缓冲液体系或水基溶液实验，而脂溶性特征则有助于在有机溶剂或疏水环境中的分布和嵌入。

稳定性与储存
Cy5-5-COOH 对光照较为敏感，在强光或高温环境下可能发生光漂白或降解，因此一般需要避光、低温储存（如 –20°C）。在干燥状态下，染料具有较长的货架寿命。在使用前可溶解于适宜溶剂（如 DMSO 或水缓冲液）中，形成均一稳定的溶液用于实验。

名称：Cy5-5-COOH 

用途：科研

状态：固体/粉末/溶液

保存：冷藏

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