Cy3.5-E 琥珀酰亚胺酯，Cy3.5-E SE的描述-UDP糖丨MOF丨金属有机框架丨聚集诱导发光丨荧光标记推荐西安齐岳生物

Cy3.5-E 琥珀酰亚胺酯（Cy3.5-E SE）是一类基于花青素结构的近红光荧光染料活化酯，具有良好的光学性质和高效的胺反应活性。其结构核心为对称扩展型Cy3.5染料，具备较长共轭体系，从而在光吸收与发射性能方面表现出较高亮度与强信号输出能力。由于采用琥珀酰亚胺活化酯（NHS ester）作为反应端基，该染料易于在温和条件下与伯胺（–NH₂）发生酰胺键结合，可用于构建多种生化探针、功能材料与纳米界面体系。

Cy3.5染料属于半花青类结构，光谱区间通常位于吸收~570–590 nm、发射~610–630 nm附近（具体峰位因溶剂与环境而异）。其共轭体系较传统Cy3更为延展，使其具备更高的光稳定性、更强的荧光量子效率，并具有更长的斯托克斯位移，从而有助于减少背景干扰并提升信号识别度。在多组分检测体系中，Cy3.5常用于中波段荧光标记，与Cy3、Cy5、FITC等染料构成分辨度较高的多色组合。

Cy3.5-E SE 的活性端基为NHS酯，其特性在于可在pH 7.5–8.5 的弱碱性环境中快速与伯胺反应形成酰胺键。这一反应选择性强、条件温和、不需要金属催化，可在水、DMSO、DMF等溶剂体系中实施。由于反应速率较快，通常可在数十分钟至数小时内完成标记过程。在无水情况下，NHS酯较稳定，但在水相中易发生水解，因此实际使用中常需控制反应时间、pH及溶剂比例。

Cy3.5-E SE 的典型应用包括：

蛋白质、肽类及多胺修饰
作为荧光标记试剂，可通过与赖氨酸残基或N端伯胺结合，实现高稳定度的酰胺链接。由于光谱性质明确，可用于分析、追踪、界面检测或荧光竞争体系。

核酸标记与分子探针构建
Cy3.5作为中波段荧光染料，广泛用于核酸探针、折叠结构分析、原位杂交(FISH)以及分子构象检测等体系。NHS酯端基可与氨基修饰核苷酸、氨基化寡核苷酸快速反应，实现单点或多点标记。

纳米材料与表面工程
Cy3.5可通过NHS酯与氨基修饰的纳米粒子、量子点、聚合物颗粒、玻璃界面、硅基表面等进行稳定共价连接，用于构建荧光编码材料、界面分析层或光响应性复合材料。

多色光谱体系
因其光谱分布独特，Cy3.5常作为Cy3与Cy5之间的中间波段，用于多组分成像或多维光谱解析体系。

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