JOE phosphoramidite, 5-isomer一种荧光标记磷酰胺化合物-UDP糖丨MOF丨金属有机框架丨聚集诱导发光丨荧光标记推荐西安齐岳生物

JOE Phosphoramidite, 5-isomer 是一种荧光标记磷酰胺化合物，属于荧光染料衍生的核酸合成试剂。其分子结构结合了荧光染料 JOE（2',7'-二氢-异硫氰酸荧光素衍生物）和磷酰胺官能团，使其能够在固相核酸合成过程中高效引入荧光标记。5-isomer 特指 JOE 分子在荧光核心的 5 号位上进行修饰的异构体，其光学性能和化学稳定性经过优化，适用于标记 DNA、RNA 及寡核苷酸。

分子结构与特性

JOE Phosphoramidite 由三个主要部分组成：

荧光核心 JOE
JOE 是一种水溶性荧光染料，吸收波长约在 520 nm 左右，发射波长约为 548 nm，呈绿色荧光。5-isomer 的修饰位置保证了荧光强度高、量子产率稳定，同时减少与核酸骨架及其他染料的相互淬灭。

磷酰胺功能团（Phosphoramidite）
磷酰胺是核酸固相合成中常用的活性磷酸酯形式，可以与 5'-羟基核苷酸快速反应形成磷酸二酯键，保证荧光染料能够高效整合进核酸链中。

保护基与连接臂
为防止反应过程中荧光团降解或非特异性反应，JOE phosphoramidite 通常带有稳定的保护基和柔性连接臂，使其在核酸合成及后续去保护步骤中保持结构完整。

化学性质

JOE Phosphoramidite 具有以下关键化学性质：

高度活性与选择性
磷酰胺末端可与 5'-羟基核苷酸迅速反应，生成稳定的磷酸二酯键，实现荧光标记核酸的高效合成。

光学稳定性
5-isomer 的荧光染料在常规核酸合成条件下稳定，不易光漂白或氧化，可在后续检测和分析中提供可靠的荧光信号。

溶解性
JOE phosphoramidite 可溶于常用有机溶剂如乙腈（ACN）、二氯甲烷（DCM）和二甲基亚砜（DMSO），便于在自动化合成仪器上使用。

化学兼容性
适用于标准 DNA、RNA 固相合成条件，包括酸性去保护和碱性脱保护过程。

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