荧光标记肽结合成像技术后可用于识别特定靶点。共聚焦或荧光显微镜的体外成像仍然是研究细胞内各种生物过程和相互作用最**的方法之一。与蛋白质不同，这些肽定位于肌动蛋白上的特定靶点，不易聚集蛋白质，因此非常适合于体外跟踪。同样，FITC标记的CPP也可被用于细胞内组分的成像，且其细胞毒性低。

其中，FITC 是一种胺活性的荧光染料，可广泛的用于标记多肽和蛋白质。合生生物在N端标记Fitc，都会建议在最后一个氨基和由异硫氰酸酯与氨基反应产生的硫脲键之间引入烷基间隔器（alkyl spacer）如氨基己酸（Ahx）。链接切割需要酸性环境，在N端标记FITC的多肽需经历环化作用来形成荧光素，通常会伴有最后一个氨基酸的去除，但当有一个间隔器如氨基己酸，或者是通过非酸性环境将目的肽从树脂上切下来时，这种情况可避免。空间位阻被认为是在荧光染料前使用Ahx的主要原因，而不是为什么FITC不能直接偶联在多肽上的原因。

肽是α－氨基酸以肽键连接在一起而形成的化合物，是蛋白质水解的中间产物。由两个氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫做二肽，同理类推还有三肽、四肽、五肽等。由三个或三个以上氨基酸分子组成的肽叫多肽。

可提供标记服务的标记物有：

生物素；

常规荧光素：FITC，Rhodamine B；
Cy系列：Cy3，Cy5，Cy5.5，Cy7；

荧光蛋白：藻红蛋白（PE），别藻蓝蛋白（APC）；
荧光双标记：PE-Cy3，PE-Cy5，PE-Cy5.5，PE-Cy7；

胶体金标记Co-Au

量子点

荧光标记多肽：

FITC标记的鬼笔环肽

FITC-胰高血糖素样肽-1

鬼笔环肽-FITC

FITC标记鬼笔环肽

荧光标记细胞穿膜肽(cell-penetrating peptides,CPPs)

荧光标记蛋白衍生肽(protein derived CPPs), 如penetratin、TAT和pVEC等；

荧光标记模型肽(model peptides) 如MAP和(Arg)7等

荧光标记设计肽(designed CPPs)如MPG和Transportan等。

荧光标记奥曲肽Octreotide CAS：79517-01-4 分子量：1019.24

荧光标记D-Phe-c[Cys-Phe-D-Trp-Lys-Thr-Cys]-Thr-ol

荧光标记阳离子肽Temporin-1CEa

荧光标记阳离子肽Temporin-1CEa药物载体系统

荧光标记cRGD多肽，环肽（新生血管靶向肽）

荧光标记精氨酰-甘氨酰-天冬氨酸环状 RGD 多肽系列：

荧光标记c(RGDfC) | cyclo (Arg-Gly-Asp-d-Phe-Cys)

荧光标记c(RGDfE) | cyclo(Arg-Gly-Asp-d-Phe-Glu)

荧光标记c(RGDfV) | cyclo (Arg-Gly-Asp-d-Phe-Val)

荧光标记c(RGDfK) | cyclo (Arg-Gly-Asp-d-Phe-Lys)

荧光标记c(RGDyC)| cyclo (Arg-Gly-Asp-D-Tyr-Cys)

荧光标记c(RGDyE) | cyclo(Arg-Gly-Asp-D-Tyr-Glu)

荧光标记c(RGDyK)| cyclo (Arg-Gly-Asp-d-Tyr-Lys)

荧光标记c(RGDyV) | cyclo(Arg-Gly-Asp-d-Tyr-Val)