5’TAMRA C12 Amidite (5-Isomer),5'-四甲基罗丹明 C12 磷酰胺衍生物(5-异构体)的化学结构特点
5’TAMRA C12 Amidite (5-Isomer)(中文名称:5'-四甲基罗丹明 C12 磷酰胺衍生物(5-异构体))是一种用于固相寡核苷酸合成的功能化荧光核苷酸中间体,其核心由 5-异构体四甲基罗丹明(TAMRA, Tetramethylrhodamine)荧光染料构成,通过长链柔性连接基(C12 linker)与核苷骨架相连,并在末端引入 2-氰乙基二异丙基磷酰胺(phosphoramidite)活性官能团。5-异构体指染料的官能团在芳香环上位于第 5 位,确保其荧光特性一致且可预测。C12 长链柔性连接基的设计可在寡核苷酸合成中将荧光染料与核酸链空间隔离,降低荧光淬灭风险,保证核酸链的二级结构和生物功能不受影响。
5’TAMRA C12 Amidite 的化学结构特点首先在于其荧光染料核心。TAMRA 属于罗丹明类染料,具有共轭 π 电子体系,使其在可见光区表现为橙红色荧光,吸收峰约在 555 nm,发射峰约在 580 nm,量子产率高且光稳定性良好。5-异构体的设计确保荧光信号稳定一致,适合定量分析和多重荧光实验。其次,C12 链连接基为长链烷基桥,提供充足的空间隔离,使染料与寡核苷酸链及相邻碱基保持一定距离,减少 steric hindrance(空间阻碍)和分子间相互作用对荧光性能的影响。
末端磷酰胺官能团是 5’TAMRA C12 Amidite 的另一结构特点,可与寡核苷酸链 5'-羟基发生亲核偶联反应,形成四面体中间体,随后二异丙基氨基离去生成稳定磷酰胺键,通过氧化剂氧化为磷酸二酯连接,实现染料高效整合。磷酰胺末端在干燥、无水有机溶剂条件下化学稳定,但对水分敏感,需要在合成过程中避免水解。DMT 或其他保护基可在必要时保护 5'-羟基,实现方向可控的固相合成。
此外,5’TAMRA C12 Amidite 的化学结构特点还包括模块化设计和兼容性高。模块化结构允许在寡核苷酸链中任意位置引入标记,实现多功能修饰,如荧光示踪、蛋白质偶联、药物递送系统构建等。C12 链的柔性还使标记物在分子中具有一定自由度,提高偶联效率,保证染料在生物体系中的光学性能稳定。染料核心结构在中性或弱碱性条件下稳定,但在强酸或强氧化环境中需避免长时间处理,以防荧光性能下降。
产品名称:5’TAMRA C12 Amidite (5-Isomer)
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物

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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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