CAL Fluor Red 635 Amidite，用于寡核苷酸合成的荧光修饰试剂

中文名称：CAL Fluor Red 635 亚磷酰胺

描述：
CAL Fluor Red 635 Amidite 是一种专门用于寡核苷酸合成的荧光修饰试剂，将CAL Fluor Red 635 荧光染料以亚磷酰胺形式连接到核苷酸上，用于寡核苷酸探针的荧光标记。CAL Fluor Red 635 是一种红色荧光染料，其激发波长约为630 nm，发射波长约为650 nm，具有明亮、稳定的荧光信号和良好的光化学稳定性。该染料通过亚磷酰胺形式可在固相核酸合成中高效引入到寡核苷酸链的末端或内部，提供荧光标记位点，用于分子检测、实时荧光定量PCR（qPCR）、荧光原位杂交（FISH）及其他核酸标记研究。

结构特点：

1. 荧光染料结构
   CAL Fluor Red 635 由共轭芳香环体系组成，含有多个电子离域的共轭双键，提供强烈的光吸收和发射能力。其红色荧光特性适用于多色荧光成像和多重标记实验，能够与其他波长荧光染料组合，实现多靶标同时检测。

2. 亚磷酰胺化学活性
   通过亚磷酰胺基团与5’-羟基反应，CAL Fluor Red 635 可在固相核酸合成中高效偶联。亚磷酰胺形式在合成过程中表现出高选择性，仅在活化剂（如tetrazole）存在时与羟基发生磷酸二酯键形成反应，确保修饰核苷酸能够可控地引入寡核苷酸序列。

3. 间隔链设计
   染料分子通常通过柔性间隔链（如乙二醇或烷基链）与核苷酸连接。这种间隔链提供空间缓冲，减少荧光染料对核酸二级结构的干扰，保证探针在杂交或酶促反应中的正常功能，同时提高标记效率和荧光信号强度。

4. 光学和化学稳定性
   CAL Fluor Red 635 的芳香共轭体系和间隔链设计保证染料在合成、纯化及储存过程中稳定，不易光漂白或降解，适用于多轮荧光检测和长期实验。

结构合成：
CAL Fluor Red 635 Amidite 的制备主要包括荧光染料合成、活化及亚磷酰胺化三个步骤：

1. 荧光染料合成
   根据红色荧光特性设计芳香环共轭体系，并引入适合偶联的官能团，如羧基或氨基。合成过程通常采用多步有机反应，包括芳香环偶联、酰化、取代及环化反应，以获得结构完整且光学性能优异的CAL Fluor Red 635 荧光染料。

2. 功能化衍生物制备
   在染料分子上引入末端羟基或氨基连接点，为后续亚磷酰胺化提供化学位点。此步骤通常需要选择适合的保护基团以保证在后续反应中结构稳定。

3. 亚磷酰胺化反应
   将功能化的荧光染料与适当的磷酰化试剂反应，生成亚磷酰胺结构。亚磷酰胺化使染料能够在固相核酸合成中通过活化剂高效偶联到寡核苷酸的5’-羟基上，实现荧光修饰。

4. 纯化与验证
   通过高效液相色谱（HPLC）纯化产物，去除未反应的中间体和副产物。通过质谱（MS）和光谱分析验证产物的结构和荧光性能，确保标记功能正常。

通过以上步骤获得的 CAL Fluor Red 635 Amidite 具有高纯度、高稳定性和可控偶联特性，可在固相合成中高效引入荧光标记，为分子探针、实时定量PCR探针、原位杂交和核酸功能化提供可靠工具。其结构特点和合成策略确保染料光学性能优异，同时在实验中兼具稳定性和反应效率。

产品名称：CAL Fluor Red 635 Amidite 

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

关于我们

齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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