Fluorescein dT Amidite,荧光素标记脱氧胸苷亚磷酰胺化物的化学结构特点
Fluorescein dT Amidite 的中文名称通常为荧光素标记脱氧胸苷亚磷酰胺化物,简称荧光素-dT 亚磷酰胺。其中,dT 表示该修饰单体对应 DNA 核苷酸中的脱氧胸苷(deoxythymidine);Fluorescein 为一种经典的绿色荧光染料,激发波长约为 495 nm,发射波长约为 520 nm;Amidite 表示分子含有活性 P(III) 磷酰胺基团,可用于固相寡核苷酸合成,将荧光素功能化整合到 DNA 链的 5’-末端或内部位置。
二、化学结构特点
荧光素结构
Fluorescein 是一个由异佛尔酮(xanthene)和苯环组成的荧光染料,具有共轭 π 电子体系,使其能够吸收特定波长光并发射可见光。荧光素通过柔性连接臂与脱氧胸苷 5’-羟基相连,保证在寡核苷酸合成和应用中保持荧光活性,同时减少对 DNA 构象和配对的干扰。dT 核苷骨架
Fluorescein dT Amidite 的核心为脱氧胸苷,保留标准核糖和胸苷碱基结构。胸苷碱基通过 N-1 位与磷酸二酯键连接 DNA 链,保持与天然 DNA 的配对能力。修饰发生在 5’-羟基位置,通过荧光素连接,不干扰胸苷的碱基识别。磷酰胺活性中心
Fluorescein dT Amidite 含有 P(III) 磷酰胺基团,是固相核酸合成的活性位点。在合成过程中,磷酰胺与前一核苷酸链的 5’-羟基偶联,形成磷酸三酯中间体,随后通过氧化剂生成稳定磷酸二酯键。磷酰胺的活性保证了荧光素标记核苷酸在 DNA 链中的高效整合。保护基与偶联位点
通常,磷酰胺上的 2-氰乙基(CE)保护基用于防止水解,而荧光素通过柔性臂与 5’-端相连。柔性连接使荧光素远离 DNA 主链,避免 steric hindrance(空间阻碍),保持荧光效率,同时保证在固相合成和后续应用中稳定性高。光学特性与应用优势
Fluorescein dT Amidite 具有高量子产率、明亮绿色荧光和较高光稳定性,适合用于荧光探针、实时 PCR 探针、荧光原位杂交(FISH)及分子成像。通过合理设计连接位置,可实现末端或内部标记,支持多通道荧光检测。
三、总结
Fluorescein dT Amidite(荧光素标记脱氧胸苷亚磷酰胺化物)是一种功能化核苷酸单体,其化学结构特点包括荧光素染料、脱氧胸苷骨架、磷酰胺活性中心和柔性连接臂。该设计保证了荧光标记核苷酸在固相合成中的高效整合、荧光活性和空间隔离性。其主要用途是制备荧光标记寡核苷酸探针、引物和功能化核酸分子,广泛应用于分子生物学、细胞成像及核酸分析实验。
产品名称:Fluorescein dT Amidite
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物

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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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