中文名称:CY5-4-巯基尿苷
英文名称:CY5-4-Thiouridine
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
保存:冷藏
供应:西安齐岳生物科技有限公司

CY5-4-巯基尿苷(Cyanine5-4-Thiouridine,简称CY5-4-ThU)是一种以巯基尿苷为基础的荧光标记核苷衍生物,通过Cyanine5(CY5)染料的共价连接实现可视化功能。其结构由两部分组成:一方面是核苷的核心——4-巯基尿苷(4-Thiouridine),在尿苷分子的4位氮原子上引入巯基(–SH),赋予其独特的化学反应活性;另一方面是CY5荧光基团,提供稳定且高强度的红光发射,使其成为分子生物学和生化实验中常用的荧光标记工具。
结构与化学特性
CY5-4-巯基尿苷的分子特点在于4-巯基尿苷本身的可反应性。4-巯基尿苷与天然尿苷相比,多了一个硫醇官能团,使其能够与多种马来酰亚胺(maleimide)、活性酯或其他亲电基团高效共价结合。CY5染料通常通过NHS酯或异硫氰酸酯方式与巯基反应,实现牢固的标记。由于CY5发射波长约为670 nm,激发波长约为650 nm,因此在红光通道具有高信噪比,且与常见的绿色荧光(如FITC)不重叠,便于多重标记实验。
CY5-4-巯基尿苷在水和有机溶剂中具有良好的溶解性,其荧光性质稳定,在不同pH条件下仍保持较高的荧光强度。这种稳定性使其能够在长时间实验操作中维持信号,同时不易发生光漂白或化学降解。此外,巯基的存在赋予其额外的可控化学修饰能力,可用于特异性偶联到含巯基的生物分子或通过点击化学进行更复杂的分子构建。
主要应用领域
核酸研究:CY5-4-巯基尿苷常用于RNA标记实验。通过在体外转录体系中掺入4-巯基尿苷,可以在RNA链上引入特定反应位点,再通过CY5染料标记,实现RNA分子的荧光可视化。这对于RNA折叠、定位以及相互作用研究提供了便捷的检测手段。
荧光探针开发:CY5-4-巯基尿苷可以作为荧光探针的核心组件,参与构建分子传感器。例如,可设计基于FRET(荧光共振能量转移)机制的核酸探针,利用CY5作为受体荧光团,通过巯基化学连接到特定位点,实现信号变化检测环境或分子结合事件。
生物大分子标记:除了核酸,CY5-4-巯基尿苷的巯基可与蛋白质、肽段上的特定氨基酸残基发生选择性共价偶联。通过这种方式,可以将荧光标记直接引入复杂生物体系,用于体外动力学研究、分子相互作用分析及纳米材料构建。
分子诊断及高通量分析:在分子筛选和高通量实验中,CY5-4-巯基尿苷由于其稳定的红光信号和化学可修饰性,被广泛应用于微阵列芯片标记、核酸探针检测以及多色荧光定量实验。其高灵敏度和低背景特性,有助于精确量化分子浓度和相互作用。
实验注意事项
光稳定性:尽管CY5具有较强的荧光稳定性,但在强光或长时间激发下仍可能发生光漂白。在操作和存储过程中,应避光保存,并在实验操作中尽量减少暴露于强光下。
化学反应条件:巯基对氧化敏感,容易形成二硫键或被氧化为硫醇氧化物。因此,在偶联反应中通常使用还原剂(如DTT)保护巯基,确保反应效率。
溶解与储存:CY5-4-巯基尿苷可溶于水或含少量有机溶剂的缓冲液中,储存温度一般为–20°C干燥避光状态,以保证长期稳定性。
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