卟啉具有独特的电子结构，产生复杂的吸收光谱。

简单卟啉（如四苯基卟啉）在400 nm左右具有很强的吸收带（ɛ~ 500,000 M-1 cm-1）。

在可见光区（500-650 nm）有一系列较弱的吸收带。

在红色光谱窗口有一个很弱的吸收带（~ 650 nm）卟啉也具有中等的荧光量子子产率（~ 0.1）。

虽然简单卟啉在红色/近红外光谱窗口中吸收较弱，荧光量子产率较低，不适合活体荧光成像。

但其较精细的衍生物在红色和近红外区域表现出较强的吸收和强荧光。

具有光学性质的衍生物最有希望在体内应用是苯卟啉、强共轭卟啉阵列和氢卟啉。

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