UDP 糖|抗生素合成UDP-glucuronate 4- epiimerase MoeE5与底物复合物的结构
发布时间:2021-12-31     作者:UDP 糖   分享到:
环孢链霉菌(Streptomyces viridosporus)的异丙基酶MoeE5将udp -葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)转化为udp -半乳糖醛酸(UDP-GalA),为合成莫尼霉素(moenomycin)提供了**个糖。
莫尼霉素是一种对细菌肽聚糖糖基转移酶的****剂。
该酶属于udp -己糖4-异丙基酶家族,以NAD+作为辅助因子。
本文报道了MoeE5/NAD+/UDP-GlcA和MoeE5/NAD+/UDP-glucose的复杂晶体结构,其分辨率分别为1.48 Å和1.66 Å。
辅因子NAD+与n端Rossmann-fold结构域结合,衬底与较小的c端结构域结合。
在这两种晶体中,底物糖基部分的C4原子靠近NAD+的烟酰胺的C4原子,糖的O4原子也与Tyr154的侧链氢键结合,表明了一种生产结合模式。
作为该蛋白家族中**个在活性位点上与UDP-GlcA结合的复杂结构,它在酶和底物之间显示出广泛的氢键网络。
我们进一步用产物UDP-GalA建立模型,发现MoeE5中独特的Arg192可能在催化过程中发挥重要作用。
因此,MoeE5可能是UDP-GlcA转化为UDP-GalA的一种特异性异丙基酶,而不是像其他家族成员那样是一种混杂酶。
UDP-L-RhaNAc | UDP-4n-D-FucNAc |
UDP-D-XylNAc | UDP-VioNAc |
UDP-2-Biotinyl-GalNAc | UDP-6-Biotinyl-GalNAc |
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