PROTAC（Proteolysis-Targeting Chimeras，蛋白水解靶向嵌合体）面临的挑战主要包括：

药物设计和优化：

PROTAC分子设计需要考虑其与靶蛋白和E3连接酶的高亲和性结合，同时还要确保分子的稳定性和药代动力学特性。这需要复杂的化学设计和优化过程。

PROTAC的linker（连接子）设计，需要足够灵活以允许分子与两个靶点同时结合，但又不能过于灵活以至于影响与靶点的结合稳定性。

药代动力学特性：

PROTAC分子往往分子量较大，可能导致其在体内的溶解性、渗透性和稳定性不佳，进而影响其生物利用度和疗效。

PROTAC在体内的分布、代谢和排泄过程也可能受到其分子结构和性质的影响，需要进一步优化以提高其药代动力学特性。

耐药性和脱靶效应：

长期使用PROTAC药物可能导致耐药性的产生，因为细胞可能通过突变或其他机制来逃避PROTAC的降解作用。

PROTAC分子可能与其他非靶标蛋白结合，导致脱靶效应，进而产生不必要的副作用。

安全性问题：

PROTAC的作用机制涉及到细胞内蛋白质降解系统的干预，可能引发细胞毒性或其他安全性问题。因此，需要对PROTAC的安全性进行严格的评估和监测。

PROTAC可能导致正常细胞蛋白的误降解，从而影响细胞的正常生理功能。

临床试验和监管：

PROTAC药物的开发需要经历严格的临床试验和监管程序，包括对其疗效、安全性和药代动力学特性的评估。这需要大量的时间和资源投入。

监管机构对PROTAC药物的审批和监管标准也可能随着技术的发展而不断变化，给PROTAC药物的研发带来不确定性。

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