Biotin-11-UTP是一种标记型核糖核苷酸，是尿苷三磷酸（UTP）的生物素修饰衍生物。其分子结构通过一个含11个碳原子的长链空间臂，将生物素分子连接到UTP的核糖部分，既保留了尿苷三磷酸作为RNA合成前体的功能，又赋予其生物素的高亲和力标签特性。该化合物的CAS号为86303-25-5，广泛应用于RNA标记、检测及生物分子纯化等多种分子生物学研究领域。

化学结构与性质

Biotin-11-UTP由三个核心部分组成：尿苷三磷酸、一个11碳的柔性空间臂以及生物素分子。空间臂设计的目的是确保生物素标签不会因体积较大而妨碍RNA聚合酶的正常识别与催化，从而保持其较高的酶学活性和高效掺入。生物素分子具有亲和素结合能力，能够实现对标记RNA分子的高效捕获和检测。

该化合物水溶性良好，通常以冻干粉或缓冲液形式提供，保存时应避光冷藏（-20℃）以确保稳定性。Biotin-11-UTP在多数常见缓冲液中稳定，适合体外转录、杂交探针制备及多种标记应用。

应用领域

体外转录标记
Biotin-11-UTP作为RNA合成的标记核苷酸，可被T7、SP6、T3等RNA聚合酶高效掺入体外转录反应中，合成带有生物素标签的RNA分子。这样合成的生物素标记RNA广泛应用于核酸杂交、RNA探针制备和分子成像。

RNA杂交与检测
利用生物素-亲和素系统，Biotin-11-UTP标记的RNA探针可以通过亲和素-辣根过氧化物酶（HRP）、亲和素-碱性磷酸酶（AP）等复合物进行信号放大，实现高灵敏度的RNA杂交检测，如Northern blot、原位杂交和芯片分析。

核酸纯化和富集
标记的RNA分子可以通过生物素亲和素结合实现特异性捕获，适用于RNA纯化、靶向富集及二代测序样品制备。磁珠或亲和柱中结合的亲和素能高效捕获带有生物素的RNA，实现目标分子的高纯度分离。

RNA功能研究
Biotin-11-UTP标记的RNA用于研究RNA的结构、结合蛋白质相互作用以及RNA介导的调控过程。通过亲和素拉下实验，研究RNA结合蛋白的鉴定与验证，助力揭示RNA在细胞功能中的作用机制。

分子诊断与纳米技术
生物素标记的RNA作为探针，被用于多种分子诊断平台，包括核酸传感器和基因表达分析，提升检测的灵敏度和特异性。此外，利用生物素-亲和素高亲和力的结合，也拓展了RNA在纳米材料和药物递送系统中的应用。

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