BODIPY 558/568 COOH 是一种基于 BODIPY（boron-dipyrromethene，硼二吡咯亚甲基）结构的红橙色荧光染料，具有良好的光学性质、高光稳定性和优异的化学修饰能力。

它的结构中引入了一个羧基（–COOH）官能团，使其能通过酰胺键偶联到蛋白质、肽、寡核苷酸或其他含氨基的分子上，广泛应用于生物成像、荧光标记、分子探针和荧光共振能量转移（FRET）研究。

常用名 BDP 558/568-羧酸

英文名 BDP 558/568 carboxylic acid

CAS号 150173-72-1

分子量 346.16

分子式 C16H13BF2N2O2S

1. 蛋白质和多肽标记

通过EDC/NHS化学或活化酰胺偶联反应，将BODIPY 558/568 COOH与蛋白质上的氨基残基（如赖氨酸）偶联，形成稳定的酰胺键，实现荧光标记。适用于Western blot、免疫组化、ELISA、细胞内追踪等。

2. 寡核苷酸与核酸探针

通过在寡核苷酸末端修饰氨基（–NH₂），可与BODIPY 558/568 COOH偶联，构建荧光探针，用于FISH、qPCR、miRNA检测等。

3. 细胞与亚细胞成像

BODIPY染料因其疏水性，可在亲脂结构（如膜、脂滴、线粒体）中积累。羧基修饰版本可用于构建靶向性探针，对特定细胞器成像提供工具。

4. FRET研究

由于其激发和发射光谱与某些供体染料（如Cy3、Alexa 546）配对良好，常用作FRET的能量受体，用于研究蛋白相互作用、酶活性变化等。

5. 流式细胞术

标记抗体后可用于多色流式分析，尤其在红色通道（如PE、PerCP）被占用时作为替代红橙色染料使用，信噪比良好，背景低。

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