Cy5.5-Phosphoramidite Monomer，CY5.5标记亚磷酰胺单体的基本结构组成

Cy5.5-Phosphoramidite Monomer是将Cy5.5染料修饰的核苷酸亚磷酰胺单体，用于寡核苷酸固相合成中实现特异性荧光标记。其反应机理核心在于亚磷酰胺与核苷酸5'-羟基的酯化反应，形成稳定的磷酸三酯键，整合染料与核酸链。

基本结构组成

亚磷酰胺基团（–P(NR2)2）：活性磷中心，具有良好的亲电性，易被羟基亲核攻击。

Cy5.5染料：通过化学连接位点与核苷酸骨架共价连接，实现荧光标记。

核苷酸单体骨架：含有5'-羟基，作为反应的亲核位点。

反应机理细节

活化步骤：亚磷酰胺基团在合成过程中，受到催化剂（如四乙基胺盐）的促进，形成亚磷酰胺活性中间体。

亲核攻击：5'-羟基的氧原子作为亲核试剂攻击磷原子，生成五配位过渡态，随后其中一个亚磷酰胺基团脱离。

形成磷酸三酯键：过渡态稳定后释放二级胺，生成带有荧光染料的磷酸三酯键，连接染料修饰的核苷酸单体到寡核苷酸链端。

氧化步骤：随后通过氧化剂（碘水溶液）将不稳定的磷硫酯键氧化为稳定的磷酸三酯键，确保链的结构稳定。

选择性与高效性

该反应机理保证了高效且选择性连接，荧光染料不会干扰核酸链的正常延伸。亚磷酰胺单体反应迅速，适合自动化合成。

反应环境与条件

反应需在无水、无氧环境中进行，防止亚磷酰胺基团被水解或氧化。温度适宜以保持染料和核酸的稳定性。

产品名称：Cy5.5-Phosphoramidite Monomer，CY5.5标记亚磷酰胺单体

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

关于我们

齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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