DBCO-SuLfo-Cy5,1564286-24-3,近红外荧光染料 Cyanine5标记二环庚炔
DBCO-Sulfo-Cy5(CAS 1564286-24-3)是一种功能性荧光标记分子,由近红外荧光染料 Cyanine5(Cy5)与二环庚炔(Dibenzocyclooctyne, DBCO)偶联形成。Cy5 提供激发波长约为 649 纳米、发射波长约为 670 纳米的近红外荧光信号,具有高光稳定性和优良量子产率,而 DBCO 是一种环张力较大的环炔,可在铜自由点击化学(Strain-Promoted Alkyne-Azide Cycloaddition, SPAAC)反应中与叠氮化物发生快速、高效且高度选择性的共价偶联。Sulfo-Cy5 的磺酸盐基团提供良好的水溶性,使整个分子适用于水性生物体系。DBCO-Sulfo-Cy5 的合成过程涉及染料活化、官能团偶联及产物纯化,其研究对于高效生物标记和点击化学应用具有重要意义。
英文名称: DBCO-SuLfo-Cy5
中文名称: Cy5 DBCO
MF: C52H56N4O11S3
MW: 1009.22
CAS: 1564286-24-3

合成的第一步通常是 Cy5 荧光染料的活化。Cy5 通常以羧基衍生物(–COOH)或 NHS 酯形式提供,NHS 酯化后的 Cy5 可与含胺基的 DBCO 分子发生亲核加成反应。在该步骤中,NHS 酯通过与胺基的亲核攻击生成稳定的酰胺键,从而将 Cy5 染料与 DBCO 分子连接起来。反应一般在有机溶剂体系中进行,如二甲基甲酰胺(DMF)或二氯甲烷(DCM),并在弱碱性条件(pH 7.5–8.5)下操作,以保证胺基非质子化,提高反应效率,同时降低 Cy5 的水解和光漂白风险。
第二步是 DBCO 的选择与偶联。DBCO 分子结构中含有高度张力的环炔,其共轭体系使其对叠氮基具有高反应活性。在合成中,DBCO 通常以胺基衍生物存在,通过其伯胺进攻 Cy5 的 NHS 酯碳原子,生成稳定的酰胺键,实现两者共价偶联。偶联反应过程中,反应温度通常控制在室温至略低,以保证 Cy5 光学性质和 DBCO 环炔活性不受影响。摩尔比的控制也很关键,过量 Cy5 或 DBCO 会导致副产物生成或反应过度修饰,而不足则偶联效率低。
第三步是产物纯化。偶联反应完成后,需要去除未反应的 Cy5、DBCO 以及副产物。常用方法包括反相高效液相色谱(HPLC)、凝胶过滤层析或硅胶柱层析。由于 Sulfo-Cy5 带有磺酸盐基团,产物在水性缓冲液中溶解性好,纯化后可直接用于生物实验。纯化过程中需注意避光操作,避免 Cy5 光漂白,同时保持 DBCO 的环炔活性,以保证其后续 SPAAC 反应效率。
第四步是产物表征。纯化后的 DBCO-Sulfo-Cy5 需通过多种分析手段确认其结构完整性和偶联效率。光谱分析(UV-Vis 和荧光光谱)用于检测 Cy5 的光学特性,确认激发和发射波长的稳定性。质谱分析(ESI-MS 或 MALDI-TOF)可确定分子量是否符合理论值,并验证酰胺键形成。核磁共振(NMR)可提供结构信息,确认 DBCO 与 Cy5 的偶联位置及官能团完整性。
最后,合成过程中需要控制化学条件以确保 DBCO-Sulfo-Cy5 的高反应活性和水溶性。磺酸盐基团提供分子在生物缓冲液中的稳定分散性,避免自聚集或沉淀,同时保持 Cy5 的荧光信号。DBCO 的环张力保证其能够在 SPAAC 点击反应中快速与叠氮化物结合,实现高效生物正交标记。
综上所述,DBCO-Sulfo-Cy5 的合成过程研究包括四个关键步骤:Cy5 染料活化、DBCO 偶联、产物纯化和结构表征。通过温和缓冲条件、摩尔比控制和避光操作,可保证偶联产物的荧光性能、环炔活性和水溶性。该分子在生物正交化学、蛋白质或核酸标记、纳米材料功能化及药物递送系统构建中具有重要应用价值,是现代生物标记和点击化学研究中的高效工具。
纯度:95%+
性状:固体或液体
储藏条件:-20°C干燥避光保存
包装规格:50mg 100mg 250mg 500mg(按需提供)
厂家:齐岳生物
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齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务,如活性酯(NHS酯)、马来酰亚胺(MAL)、叠氮(N₃)、炔基(alkyne)等,便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合,实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外,齐岳生物还提供定制染料标记服务,包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物,满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。
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