JOE Amidite，JOE 荧光染料核苷亚磷酰胺化物的反应原理

JOE Amidite 的中文名称通常为JOE 荧光染料核苷亚磷酰胺化物，也可称为JOE 标记核苷亚磷酰胺。其中，JOE 是一种黄色荧光染料（6-Carboxy-4’,5’-dichloro-2’,7’-dimethoxyfluorescein 的衍生物），激发波长约为 520 nm，发射波长约为 548 nm，具有高量子产率和良好的光稳定性；Amidite 表示分子含有活性 P(III) 磷酰胺基，可用于固相寡核苷酸合成，实现在 DNA 链 5’-末端或内部的荧光标记。

二、反应原理

1. 磷酰胺偶联机制
   JOE Amidite 含有 P(III) 磷酰胺基团，在固相 DNA 合成中可与前一核苷酸链的 5’-羟基（–OH）发生亲核加成，形成不稳定的磷酸三酯中间体。该过程通常在有机溶剂（如乙腈）中进行，并在四唑类活化剂（如 5-苯基-1H-1,2,4-三唑）催化下加速反应，使磷酰胺与 5’-羟基高效偶联。

2. 氧化生成稳定磷酸二酯键
   磷酸三酯中间体通过氧化剂（如碘水溶液或亚硫酸盐）氧化生成稳定的磷酸二酯键，确保寡核苷酸链延伸完成并稳定存在。此步骤是固相 DNA 合成循环的重要环节，保证荧光标记的核苷酸被有效整合入寡核苷酸链中。

3. 荧光染料保护与活性
   JOE 荧光团通过柔性连接臂与磷酰胺基团连接，使其在合成过程中不干扰链延伸反应，同时保持荧光活性。合成完成后，荧光染料通过 5’-末端暴露在寡核苷酸链外，便于后续检测、成像或偶联实验。

4. 兼容性与操作条件
   JOE Amidite 设计用于标准固相 DNA 合成流程，兼容其他核苷酸单体。其反应条件温和，一般在室温、无水有机溶剂环境下进行，避免水解和染料降解。同时，合成完成后的荧光标记稳定，可在缓冲液中用于免疫分析、qPCR、荧光原位杂交（FISH）及多通道成像。

5. 末端功能化与应用
   通过磷酰胺偶联，JOE 荧光染料可被共价固定在 DNA 链 5’-末端或内部特定位点，为荧光探针、引物和标记核酸的构建提供高效手段。黄色荧光信号可与其他颜色荧光染料组合，实现多通道检测和分子共定位分析。

三、总结
JOE Amidite（JOE 荧光染料核苷亚磷酰胺化物）是一种用于固相 DNA 合成的功能化单体，其反应原理包括磷酰胺与 5’-羟基的偶联、磷酸三酯氧化为二酯键以及荧光团通过柔性连接臂保持活性。该反应机制保证荧光标记核苷酸高效整合到寡核苷酸链中，并具有良好的稳定性和生物兼容性，广泛应用于荧光探针、标记引物和分子成像实验中。

产品名称：JOE Amidite

纯度：95%+

性状：固体或液体

储藏条件：-20°C干燥避光保存

包装规格：50mg  100mg  250mg  500mg（按需提供）

厂家：齐岳生物

关于我们

齐岳生物供应近红外荧光花菁染料标记各种官能团的定制服务，如活性酯（NHS酯）、马来酰亚胺（MAL）、叠氮（N₃）、炔基（alkyne）等，便于与蛋白质、肽、多糖、抗体、寡核苷酸、纳米颗粒等共价偶联。可选择多种功能团与目标分子进行精准结合，实现对蛋白质、多肽、抗体、核酸或纳米材料的荧光修饰。此外，齐岳生物还提供定制染料标记服务，包括肽类、蛋白类、小分子、糖类等不同类型标的物，满足用户在科研、成像等多方面的个性化应用。

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