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Alkyne-Diazirine-CONH-Pomalidomide,炔烃-双吖丙啶-酰胺-泊马度胺的结构设计
发布时间:2026-04-07     作者:wsw   分享到:

中文名:炔烃 - 双吖丙啶 - 酰胺 - 泊马度胺

英文名:Alkyne-Diazirine-CONH-Pomalidomide

Alkyne-Diazirine-CONH-Pomalidomide,中文全称炔烃 - 双吖丙啶 - 酰胺 - 泊马度胺,是一种集靶向识别、光活性交联与点击化学富集于一体的模块化多功能探针,专为免疫调节类药物的分子机制研究与靶点鉴定设计,是化学生物学交叉领域的典型创新分子。其分子式为 C21H19N5O5,分子量 421.41,外观为白色至浅粉色固体粉末,易溶于 DMSO、DMF 等极性有机溶剂,微溶于水,需在 - 20℃避光条件下储存。

该探针采用四模块拼接式结构设计,各单元功能明确且协同互补:核心靶向单元为泊马度胺(Pomalidomide),作为沙利度胺衍生物,能特异性结合细胞内的 Cereblon(CRBN)蛋白,介导下游泛素化降解通路,是探针实现靶向识别的关键;连接单元为酰胺键(-CONH-),通过温和的缩合反应将泊马度胺与双吖丙啶环共价连接,结构稳定且不干扰两端功能基团活性,保证探针在复杂生物环境中不发生断裂;光活性单元为双吖丙啶环(Diazirine),在 365nm 紫外光照射下可释放氮气生成高活性卡宾中间体,与邻近靶蛋白的氨基酸残基形成不可逆共价键,实现药物 - 靶点的稳定交联;富集单元为末端炔基(Alkyne,-C≡CH),可与叠氮化物发生铜催化叠氮 - 炔环加成(CuAAC)点击化学反应,快速连接荧光基团、生物素或磁珠标记物,为后续靶标分离、富集与检测提供便捷通道。

其工作机制遵循 “靶向结合 - 光交联 - 点击富集 - 质谱鉴定” 的完整流程,精准解决传统药物靶点研究中 “瞬时相互作用难捕获、低丰度复合物难富集” 的痛点。实验中,首先将探针加入细胞裂解液或活细胞体系,泊马度胺单元特异性识别并结合 CRBN 蛋白及相关复合物;随后用 365nm 紫外光低温照射,双吖丙啶环光解生成卡宾,与 CRBN 蛋白及邻近结合蛋白发生共价交联,锁定瞬时相互作用;接着加入叠氮 - 生物素标记物,通过点击化学反应为交联复合物标记生物素标签;*后利用链霉亲和素磁珠富集标记复合物,经洗涤、酶解后,通过高分辨质谱鉴定复合物中的蛋白质组分,明确泊马度胺的直接靶点与互作网络。

相较于传统探针,该分子具有三大核心优势:一是靶向特异性强,依托泊马度胺的精准结合能力,可聚焦 CRBN 通路相关蛋白,减少非特异性交联干扰;二是交联效率高,双吖丙啶环光解条件温和,卡宾活性强,能高效捕获邻近蛋白,适配活细胞、组织等复杂体系;三是富集灵敏度高,炔基 - 叠氮点击化学反应专一性强、反应速率快,可实现低丰度交联复合物的高效富集,大幅提升质谱鉴定成功率。

除药物靶点鉴定外,该探针还可用于药物作用机制解析、蛋白 - 蛋白相互作用网络构建、小分子药物结合位点定位等研究。例如,通过对比不同细胞状态下的交联谱图,可分析疾病状态对 CRBN 互作组的影响;通过突变体实验,可精准定位泊马度胺与 CRBN 的结合位点,为药物结构优化提供依据。

实验操作需严格避光,探针储存与配制全程避免光照,紫外光照射时间需精准控制,防止过度交联导致蛋白变性。作为新一代多功能光亲和探针,Alkyne-Diazirine-CONH-Pomalidomide 突破了传统研究方法的局限,为免疫调节药物的分子机制研究、靶点发现及新药研发提供了高效、精准的技术工具。

Alkyne-Diazirine-CONH-Pomalidomide,炔烃-双吖丙啶-酰胺-泊马度胺

产地:西安

供应商:西安齐岳生物科技有限公司

纯度:99%

用途:仅用于科研

温馨提示:仅用于科研,不能用于人体实验!

 

关于我们:

西安齐岳生物科技有限公司是一家从事原料药、MOF,离子液体 ,PEG衍生物、科研试剂、多肽、光电材料、碳纳米管、纳米材料、脂质体、合成磷脂的研发、定制合成、生产和销售的高科技生物科技有限公司。

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